Hola Miflobor, bienvenido a RinCAD, esperamos verte con frecuencia por aquí.
Hasta donde yo se y conozco los programas CAD, no recuerdo que ninguno te deje "insertar" una pieza dentro de otra y ya menos que te mantenga el árbol de operaciones. En Solid Works no se si existe alguna posibilidad de combinar dos piezas en una sola, a partir de un conjunto, pero en el programa que yo utilizo si existe. Se hace un conjunto con ambas piezas, posicionandolas como queremos que estén, lo guardamos, abrimos una pieza nueva y utilizamos el comando "Derivar" (ojo, en SW seguramente ni exista esta opción). Al ejecutar este comando, nos sale una ventana que nos deja seleccionar un conjunto o pieza, seleccionamos el conjunto (podemos escalarlo, hacer simetría) y si no le indicamos nada, nos une las dos piezas. También podríamos hacer una pieza con separación de caras (no las fusiona), podríamos restar una a la otra o convertirlas en superficies.
Pero la pieza resultante no tiene árbol de operaciones, aunque puedes añadirle las que tu quieras. Y si quieres modificar la geometría de alguna de ellas, has de abrir la pieza que necesites y modificarla a tu gusto.
Repito, esto es con INVENTOR, desconozco si SW tiene esa posibilidad.