Hola Bearxxl, no se que es lo que quieres, pero en alguna ocasión he intentado convertir un stl a sólido y la verdad, he sufrido mucho y he conseguido poco. Catia tiene la posibilidad (con mucho trabajo, me parece), de hacer algo de lo que dices, pero no sale un sólido "bueno", tiene demasiadas imperfecciones y es muy complejo de "retocar".
Desconozco la app que comentas de Inventor (la estoy viendo ahora), pero lo que si te diré que no veo en ningún lado que ponga su precio. Lo que si veo es que has de estar suscrito al Centro de suscripciones de Autodesk, vamos, que has de tener un programa original, o mejor dicho, has de pagar el mantenimiento anual. ¿Por que lo digo?, porque donde trabajo teníamos el mantenimiento contratado y teníamos cuenta (yo la tenía), pero como era un gasto muy grande para 20 licencias, se optó por otro método, el pago de las renovaciones. Por lo tanto no me deja bajarla ni para probarla, así que no se si verdaderamente hace lo que dice.
Y dudo mucho que exista alguna alternativa y menos que sea gratuita.