Tengo un problema para entender.
Como no puedo ver el ni el "Part Navigator" ni el "Assembly Navigator", solo puedo adivinar como el modelo fue hecho.
Es el modelo un ensamblaje o una parte en la cual fueron modelados todos los tubos?
Otra duda es, que entender por problema con las uniones?
Acaso intenta cerrar ese agujero con una superficie?
Si así fuera la intención, podría hacerse con el comando "N-sided Surface", con la precaución que en campo "Setttings" marque el casillero "Trim to Boundary".
Si el problema fuera que los tubos necesitan ser recortados, la solución es fácil y obvia.
Use el comando "Trim Body".
Con respecto a las soldaduras.
NX las modela como objetos sólidos, tal cual son en la realidad.
En NX 7.5 fui incapaz de crear soldaduras en partes que tenían varios cuerpos sólidos y debí recurrir a crear ensamblajes para poder aplicarlas. Ahora descubro que si es posible hacerlas sin usar un ensamblaje en NX 8.5.
Debido a que la cantidad de soldaduras puede crecer muy rápidamente, el rendimiento de la tarjeta de vídeo puede sufrir considerablemente. Por ello seria recomendable crear un "Reference Set" que las excluya.