Si, estoy de acuerdo que con editarlo lo cambias de layer, pero no cambias las entidades de layer. Y si las cambias, te seguirá pasando lo mismo.
Lo que pongas en el layer1, estará siempre en el layer1, crees el bloque en el layer2 o el que quieras. Y si apagas el layer1, del bloque desaparecerán todos los elementos del layer1.
O estoy muy equivocado, o eso es igual aquí, que en la luna. Ya hace años que no uso de continuo Autocad (hora lo uso en contadas ocasiones), pero nunca he visto, ni he podido desactivar un layer y que sus elementos se vean dentro de un bloque, este en el layer que este.
Pero si tu dices que no es suficiente, espero que me enseñes como se puede hacer, porque no lo veo. Tu o cualquier otro usuario.